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陆道培医院分子医学室开展新项目:用转录组测序全面解析血液肿瘤致病融合基
近日,陆道培医院分子医学室开展「白血病少见融合基因及融合基因家族成员分析」项目。
该项目用转录组测序全面分析血液肿瘤中的致病融合基因,能够有效分析常见融合基因、融合基因家族和少见、变异型融合基因。项目名称中突出了「少见融合基因」和「融合基因家族」,是为了强调该项目与现有的 PCR 法筛查常见融合基因项目互补,而非替代。
白血病少见融合基因及融合基因家族成员分析
1、项目特点和应用建议
- 白血病少见融合基因及融合基因家族成员分析
用转录组测序全面分析可能存在的在血液肿瘤中具有病理意义的融合基因;分析内容包括各种可能存在的常见和少见型融合基因,以及常见融合基因的变异型;检测灵敏度约 15%。
需要血液病专业知识和经验丰富的分子病理医师进行结果分析和报告解读。
报告周期较长,约 10-15 个工作日;费用较高,3900 元 / 项检测。
推荐用于:常见融合基因筛查阴性的患者,进一步分析可能存在的融合基因。
也适用于:初诊和复发白血病患者直接进行全面的融合基因筛查。
- 白血病融合基因筛查(41 种)
靶向检测相对常见的融合基因和常见的基因型。
报告速度快,1 个工作日;费用较低,1560 元 / 项检测。
推荐用于:对初诊和复发白血病患者进行常见融合基因筛查。
2、项目开发和分析团队支持
- 17 年磨一剑,持续改进的项目设计和分析能力
·? 融合基因筛查的首倡和持续改进团队
·? 超过 2 万例融合基因筛查经验
·? 具有综合实力的基因组分析团队
·? 超过 1 千例转录组分析实践和高清融合基因图谱数据库支持
血液肿瘤中的融合基因
大多数融合基因是两个正常的基因分别发生断裂,然后错误拼接的产物。如正常的 BCR 基因和 ABL1 基因各自断裂后错误拼接出 BCR-ABL1 融合基因,所产生的 BCR-ABL1 融合蛋白也是正常 BCR 蛋白的一部分与正常 ABL1 蛋白的一部分错误拼接的产物。该融合蛋白的调控和功能发生了紊乱,是导致肿瘤发生,包括慢性粒细胞白血病(CML)、部分急性淋巴细胞白血病(ALL)和少数急性髓性白血病(AML)发生的最关键病因。
BCR-ABL1 是当前血液肿瘤中研究最深入,也是靶向治疗最成功的融合基因。伊马替尼、达沙替尼等 BCR-ABL1 靶向药的应用,极大地改善了 CML 的预后,患者的长期生存率已接近总体人群。靶向药的使用还可以帮助 BCR-ABL1 阳性的急性白血病患者获得疗效的改善。
血液肿瘤中还有很多其他的融合基因,也是导致肿瘤发生的主要分子病因,对血液肿瘤的诊断分层、预后评估和治疗选择具有重要意义。因此,目前国际权威的世界卫生组织(WHO)的血液肿瘤分类标准中,已经对数十种融合基因阳性的血液肿瘤分别单独分类,即直接用对应的融合基因来命名白血病的分类,如「BCR-ABL1 阳性的 AML」等。
血液肿瘤中融合基因种类众多,目前文献中已报道的已有上千种,最新版 WHO 分类标准中明确列出的融合基因有 110 多种。每种融合基因的特点不同,发生率也有很大差异,有的常见,而更多融合基因单个罕见。同一融合基因也可能有多种序列,如 CBFB-MYH11 有十多种不同的基因型、BCR-ABL1 已报道有数十种变异型。有的基因还可能与多种伙伴基因发生融合,如 KMT2A(MLL)已报道的伙伴基因已超过 200 种,PDGFRB 的伙伴基因已有数十种。
融合基因筛查的发展历史
约 20 年前,血液肿瘤中已报道的融合基因已经有数十种,它们的重要意义也已经被认可。但临床如何有效地检测越来越多的融合基因成为新的问题。当时北京大学第一医院的朱平教授较早认识到:对初诊白血病患者先进行多种常见的融合基因筛查,然后针对阳性的融合基因定期监测,是临床应用最经济有效的方式。
但纳入筛查的目标融合基因的选择、实验平台和方法的选择以及检测方案的设计都是复杂而具挑战性的工作。朱平教授带领研究生们率先在国内开展融合基因筛查的检测方案开发、相关研究和应用推广(中华血液学杂志,2003; 北京大学学报 (医学版),2005),经过十多年的推广应用,对初诊白血病患者进行常见融合基因筛查现已被广泛接受为血液肿瘤的诊疗常规。
文章来源:《航空航天医学杂志》 网址: http://www.hkhtyxzz.cn/zonghexinwen/2020/0909/507.html
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